Chordopoxvirinae - Chordopoxvirinae

Chordopoxvirinae
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Nucleocytoviricota
Учебный класс:Pokkesviricetes
Заказ:Chitovirales
Семья:Поксвириды
Подсемейство:Chordopoxvirinae
Роды

См. Текст

Chordopoxvirinae является подсемейством вирусы в семье Поксвириды. Люди, позвоночные и членистоногие служат естественными хозяевами. В настоящее время в это подсемейство входит 52 вида, разделенных на 18 родов. Заболевания, связанные с этим подсемейством, включают: оспа.[1][2]

Четыре рода этого подсемейства содержат виды, поражающие людей: Моллюсковирус, Ортопоксвирус, Парапоксвирус, и Ятапоксвирус.

Вирусология

Вирионы обычно окутанный хотя внутриклеточный зрелый вирион форма вируса, которая содержит другую оболочку, а также является заразной. Они различаются по своей форме в зависимости от вида, но обычно имеют форму кирпича или овальную форму, похожую на округлый кирпич, потому что они окружены эндоплазматической сетью. Вирион исключительно большой, около 200 нм диаметром и длиной 300 нм, и несет геном в одноцепочечном, двухцепочечном сегменте ДНК.[3] Геномы линейны, длиной около 130-375 килобайт.[1]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
ЯтапоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
ЦервидпоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
ЛепорипоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
СуипоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
МоллюсковирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
КрокодилидпоксвирусЯйцевидныйОкутанныйЛинейныйОдночастный
КаприпоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
ОртопоксвирусВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
AvipoxvirusВ форме кирпичаОкутанныйЛинейныйОдночастный
ПарапоксвирусЯйцевидныйОкутанныйЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных белков к гликозаминогликанам хозяина (ГАГ), которые опосредуют эндоцитоз вируса в хозяйскую клетку. Слияние с плазматической мембраной высвобождает ядро ​​в цитоплазму хозяина. На ранней стадии ранние гены транскрибируются в цитоплазму вирусной РНК-полимеразой. Раннее выражение начинается через 30 минут после заражения. Ядро полностью не покрыто, так как заканчивается ранняя экспрессия, вирусный геном остается в цитоплазме. В промежуточной фазе экспрессируются промежуточные гены, запускающие репликацию геномной ДНК примерно через 100 минут после заражения. На поздней стадии поздние гены экспрессируются от 140 минут до 48 часов после заражения, производя все структурные белки. Сборка дочерних вирионов начинается на цитоплазматических вирусных фабриках, производя сферическую незрелую частицу. Эта вирусная частица созревает в внутриклеточный зрелый вирион в форме кирпича, который может высвобождаться при лизисе клеток или может приобретать вторую двойную мембрану из транс-Гольджи и зачатка в качестве внешних рецепторов-хозяев вириона, которые опосредуют эндоцитоз. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина с помощью микротрубочкового транспорта вируса наружу и существует в телах окклюзии после гибели клетки и остается заразным до тех пор, пока не найдет другого хозяина. Естественным хозяином служат люди, позвоночные и членистоногие. Пути передачи: фомитовые, контактные и переносимые по воздуху частицы.[1]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
ЯтапоксвирусОбезьяны; бабуиныНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаКонтакт; насекомые
ЦервидпоксвирусОленьНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный
ЛепорипоксвирусЗайцеобразный; белкиНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаЧленистоногие; контакт
СуипоксвирусСвиньяНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный
МоллюсковирусЛюдиНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаСекс; контакт
КрокодилидпоксвирусКрокодилыНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный
КаприпоксвирусОвца; козел; крупный рогатый скотНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаЧленистоногие; контакт
ОртопоксвирусЛюди; млекопитающиеНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаВирус натуральной оспы; Респираторный; контакт; зооноз
AvipoxvirusПтицыНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаЧленистоногие; аэрозоль
ПарапоксвирусЛюди; млекопитающиеНиктоГликозаминогликаныЛизис; подающий надеждыЦитоплазмаЦитоплазмаЗооноз; контакт

Таксономия

Классификация в этом подсемействе основана на морфологии, типе нуклеиновой кислоты, способе репликации, организмах-хозяевах и типе вызываемого заболевания.

Выделяют девять родов этого подсемейства; кроме того, ряд видов еще не отнесен к роду.

Вид в роду Avipoxvirus заразить птицы; те в роде Поксвирус каймана и Крокодилипоксвирус оба заражают крокодилов.

Остальные роды этого подсемейства заражают млекопитающие.

Выделяют следующие роды:[2]

Эволюция

Существовал последний общий предок современных поксвирусов, поражающих позвоночных. 0.5 миллион лет назад. Род Avipoxvirus отошли от предка 249 ± 69 тыс. лет назад. Предок рода Ортопоксвирус был следующим, чтобы отклониться от других клад в 0.3 миллион лет назад. Согласно второй оценке времени расхождения, это событие произошло 166 ± 43 000 лет назад.[4] Разделение Ортопокс в дошедшие до наших дней виды произошли около 14 000 лет назад. Род Лепорипоксвирус разошлись около 137 ± 35 000 лет назад. Затем последовал предок рода Ятапоксвирус. Последний общий предок Каприпоксвирус и Суипоксвирус разошлись 111 ± 29000 лет назад.

Байесовское исследование геномов ортопоксии предполагает, что неклассифицированные Поксвирус йока отошли от линии, породившей ортопоксвирусы примерно 90 000 лет назад.[5] Ортопоксвирусы отделились от других вирусов оспы около 10 000 лет назад. Вирусы верблюжьей оспы, татерапии и натуральной оспы возникли 3500 лет назад, а вирус конской оспы - 3000 лет назад. Эти вирусы могли возникнуть в районе Африканского Рога.

Другое байесовское исследование предполагает, что натуральная оспа возникла около 3500 лет назад.[6]

Рекомендации

  1. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  2. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 9 мая 2020.
  3. ^ Международный комитет по таксономии вирусов (15 июня 2004 г.). "ICTVdb Описание: 58. Poxviridae". Получено 26 февраля 2005.
  4. ^ Бабкин И.В., Бабкина И.Н. (2011) Молекулярное датирование в эволюции поксвирусов позвоночных. Intervirology 54 (5): 253-260. Дои:10.1159/000320964.
  5. ^ Бабкин И.В., Бабкина И.Н. (2012) Ретроспективное исследование молекулярной эволюции ортопоксвирусов. Заразить Genet Evol
  6. ^ Бабкин И. В., Щелкунов С. Н. (2008) Молекулярная эволюция поксвирусов. Генетика 44 (8): 1029-1044

внешняя ссылка